El 8 de mayo de 2009 en la Sala Amarillas del campus Mexicali, José Luis Bonilla Esquivel presentó su examen de titulación con el cual concluyó la Maestría en Educación. Su proyecto de tesis "Evaluación de la reforma curricular de 2004 en CETYS Universidad desde la perspectiva de los estudiantes", fue expuesto al Dr. Alberto Gárate Rivera, Director del Centro de Formación Humanista, quien fungió como presidente; al Mtro. Luis Enrique Linares Borboa, Coordinador de Ciencias Sociales y Humanidades, quien participó como Secretario; y al Dr. Hugo Méndez Fierros, especialista en periodismo y Desarrollo Global, como vocal.El proyecto de José Luis Bonilla consistió en una valoración a los indicadores de la reforma a los planes de estudio del 2004, mediante un ejercicio cualitativo y cuantitativo, en el que participaron alrededor de 168 egresados en el 2008, de los campus Mexicali, Ensenada y Tijuana, quienes externaron su opinión sobre el acompañamiento que se les dio durante su estancia como estudiantes ante la reforma curricular del 2004.
Alcanza Grado de Maestro en Educación

